诱导治疗
狼疮性肾炎治疗的诱导期是指治疗初始阶段，时间通常为6～12个月。对于增生性狼疮性肾炎（ISN–RPSIII和IV级狼疮性肾炎）的诱导治疗，欧洲-狼疮性肾炎试验方案采用的低剂量环磷酰胺（固定剂量为mg，每2周给药6次）与NIH大剂量治疗方案（每月mg/m2，然后每3个月一次）疗效相当。
为了追求更安全有效的治疗方法，对霉酚酸酯进行了研究。尽管霉酚酸酯尚未获得狼疮性肾炎的监管批准，但一些研究表明霉酚酸酯与环磷酰胺在狼疮性肾炎的诱导上是等效的。麦考酚酸酯的典型诱导剂量为每天2.0g至3.0g，但具体剂量取决于种族，其中白人患者和黑人患者使用最高剂量，而亚洲患者则低于最大剂量。在长期维持期间，剂量减少33%～50%。荟萃分析显示，在治疗反应方面，霉酚酸酯和钙调磷酸酶抑制剂（包括它们的组合）优于环磷酰胺。
维持治疗
霉酚酸酯和硫唑嘌呤仍然是维持治疗的选择。在年发表的一项关键研究中，Contreras和同事发现，使用硫唑嘌呤或霉酚酸酯相较于维持性静脉注射环磷酰胺，患者的生存期更长，慢性肾功能不全的发生率更低。
随后，两个RCT比较了霉酚酸酯和硫唑嘌呤：Aspreva狼疮管理研究发现，相较于硫唑嘌呤，霉酚酸酯三年维持期的治疗失败率降低了50%；然而，在MAINTAIN肾炎试验的前5年或10年的随访中，霉酚酸酯没有显示出显著的优越性。一项荟萃分析发现，霉酚酸酯在维持治疗期间防止复发的作用优于硫唑嘌呤。
替代方案
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钙调磷酸酶抑制剂
钙调磷酸酶抑制剂已被推荐用于难治性III或IV级狼疮性肾炎，但是限于6个月的诱导治疗。药物副作用也受到广泛